1.肠梗阻
中国医科大学综合报道的83例小儿美克尔憩室中，憩室粘连所致肠梗阻无肠坏死29例，有肠坏死8例；憩室所致急性肠套叠8例，慢性肠套叠1例，共46例（55.4%），最近我院遇到1例新生儿因美克尔憩室及索带嵌入肠管，而形成腹内疝绞窄、肠梗阻腹膜炎、肠穿孔，急诊手术，切除坏死肠管及憩室而治愈。
一般报道美克尔憩室25%～54%发生肠梗阻。憩室所致肠梗阻主要为低位，且多为绞窄性，与其他粘连索带所致小肠梗阻难于鉴别。憩室作为起点内翻所引起的肠套叠，多在手术中或手术后检查病理标本时才能确定。 由美克尔憩室所致低位肠梗阻主要表现有：阵发性哭闹或腹痛，伴恶性、呕吐，甚者发热、腹痛后排便、排气减少或停止排便、排气，伴有肠套叠者，可出现果酱样血便，腹部触及腊肠型肿块，伴脐周压疼。如果伴有肠扭转或绞窄肠梗阻者，病情急剧恶化，有明显水肿及电解质紊乱，重者出现休克及腹膜炎。
2.憩室溃疡出血
由于憩室内有异位胃黏膜，其腺体为胃底腺，同时也有幽门腺。胃底腺由分泌盐酸的壁细胞、分泌消化酶的主细胞及黏液细胞组成。幽门腺由黏液细胞和“CT”细胞组成，“CT”细胞能分泌胃泌素。憩室内异位胃黏膜中胃底腺分泌的盐酸及幽门腺中“CT”细胞分泌的胃泌素刺激壁细胞大量分泌盐酸，腐蚀憩室的黏膜和血管，可引起黏膜糜烂和消化性溃疡，结果可导致出血和憩室穿孔。
在美克尔憩室致血便的病例中，异位黏膜的检出率高达81%～100%。而引起溃疡出血约占30%，最高可达70%，多见于婴幼儿，一般无前驱症状、呕吐等胃肠道症状，一般为突然出现无痛性全血便，大量便血，伴或不伴有腹痛，起初为黑紫色或黑褐色血便，混有粪质；大量出血时血便为暗红色或鲜红色，一昼夜内可有3～5次，可持续2～3天。病儿很快出现面色苍白、口渴、烦躁不安、精神萎靡、脉细速无力、四肢凉、尿少等失血性休克表现。但此时腹部体征极少，偶有轻压痛。多数病儿在经过输血及其他支持疗法保守治疗后，便血可以暂时停止，但经过一些时间又重复出血。如出血不止，小儿则出现贫血现象。在我们收集的资料中，憩室出血者占25%。