3岁以下的婴幼儿非常容易患腹泻，因为消化系统发育不成熟，消化酶和消化液分泌较少，消化酶活力较差，不能适应所进食物的质和量的变化。而且也是人的一生中生长发育最快的时期，因此需要大量的营养物质，消化道处于高负荷状态，很容易引起消化功能紊乱，而且婴儿胃酸酸度低，排空快，因此不能有效的阻止进入胃中的病原体。婴幼儿免疫机制不健全，胃肠道的分泌型lgA水平低，肠道的正常菌群未建立，家长滥用抗生素造成肠道菌群紊乱、在护理孩子的过程中不注意卫生，因此很容易引起肠道感染而至腹泻。
腹泻分为感染性和非感染腹泻。大家平常熟知的感染性腹泻有：轮状病毒性肠炎(原称：秋季腹泻)、大肠杆菌肠炎、细菌性痢疾、肠道外感染(症状性腹泻)。
感染性腹泻可以通过发病季节、接触史、喂养史以及化验室的检查(大便常规或者大便细菌培养……)很快查明，遵照医嘱进行治疗就可以了。不过需要提醒家长注意的是：只有细菌感染引起的腹泻才可以使用抗生素。非感染性腹泻，和轮状病毒性肠炎是不可以使用抗生素的，否则不但不能治愈反而引起孩子的耐药性，造成疾病迁延不愈或者合并霉菌性肠炎，那时再治疗起来就麻烦了。
但是非感染性腹泻发生的原因就比较复杂：因为喂养不当和过早添加辅食引起的食饵性腹泻、对牛奶蛋白或某些食物过敏或不耐受、或者气温变化受凉所致、小婴儿频繁调换不同品牌奶粉喂养、其它疾病并发的症状性腹泻、环境改变搅乱了原来的生活规律造成的。
食饵性腹泻：
过早的添加辅食，例如，鸡蛋、谷类等。世界卫生组织的建议婴儿6个月以后再添加辅食。因为人类的肠粘膜屏障包括它的物理性保护机制(胃酸、粘液、蛋白水解酶、肠蠕动和粘膜表皮)以及肠淋巴组织、分泌性免疫球蛋白A、细胞免疫的免疫性保护机制，要到婴儿6个月时才能发育完善；而且消化酶系统也发育不成熟，过早的添加辅食，孩子不能很好消化；而且添加的食物的性状也不适应该年龄段的孩子食用；在短时期内频繁大量添加新的食品，加重消化系统的负担，引起胃肠道功能紊乱，造成孩子腹泻；过食生冷、食物杂乱，进食无规律，对于1岁以内的婴儿引起腹泻还有一个重要的原因，就是家长频繁的调换不同品牌的配方奶粉喂养。国家规定了配方奶中必须强化的营养素品种，但在每种营养素的添加量上只规定了一个允许值范围，因此每个配方奶生产厂家根据国家的规定，结合自己的生产工艺、成本和市场的需求制定了自己的产品的配方。同时有的厂家以母乳为蓝本，经过研发也添加了一些国家还没有规定，但母乳中存在的、对婴幼儿生长发育非常有益的营养物质。并且每个厂家根据婴幼儿不同的发育阶段的特点研制和生产了一系列的配方奶粉，因此说每个厂家生产的配方奶与其它厂家是有区别的，因此频繁的调换不同品种的配方奶粉，很容易造成孩子消化道不适应，引起胃肠功能紊乱而发生腹泻。尤其现在配方奶粉市场目前竞争十分激烈，一些人出于某种目的在网络等媒体上散布一些不负责任言论，误导一些不明真相的家长，也不顾小婴儿换奶粉需要循序渐进逐渐替换的原测，马上给自己的孩子换另一种品牌的奶粉，结果造成孩子胃肠道不适应，引起腹泻。