3月份，湖南报告手足口病病例4201例，其中重症病例24例，死亡1例，病例数比上月增加89.15%。居前5位的市州依次为：长沙（673例）、邵阳（481例）、娄底（441例）、湘西州（435例）、郴州（405例）。
4月22日，湖南省卫生厅发布《湖南省手足口病预防控制工作方案（2013年版）》，省卫生厅成立手足口病预防控制专家指导组，成立7个由有关方面专业技术人员组成的疫情现场处置机动队，负责重大手足口病疫情流行病学调查及现场处置等工作。
根据方案，医疗机构、托幼机构和小学等单位发现手足口病聚集性或暴发疫情时，应当在24小时内向当地县市区疾控中心报告。出现重症或死亡病例，或1周内同一班级出现2例及以上病例，建议病例所在班级停课10天；1周内累计出现10例及以上，或3个班级分别出现2例及以上病例时，可建议托幼机构等集体单位停课关园(校)10天，并出具书面预防控制措施建议书。
根据方案，应采取各种措施促进患儿及早就医，并遵医嘱采取居家或住院方式进行隔离治疗，对需要退热的患儿慎重选择退热药物，常用退热药物有乙酰胺基酚和布洛芬，严禁使用激素退热，禁止使用氨基比林、复方氨基比林等吡唑酮类药物。
聚集性疫情，指一周内，同一托幼机构或学校等集体单位发生5例以上，但不足10例手足口病病例；或同一班级(或宿舍)、同一家庭发生2例及以上手足口病病例；或同一个自然村/居委会发生3例及以上，但不足5例手足口病病例。
暴发疫情，指一周内，同一托幼机构或学校等集体单位发生10例及以上手足口病病例；或同一个自然村/居委会发生5例及以上手足口病病例，或发生2例及以上死亡病例。