夏四月十六日，口厌哒国派使者朝贡。五月二十日，任命司空、任城王元澄为司徒，骠骑大将军、仪同三司、京兆王元继为司空。
秋八月十四日，御史中尉、东平王元匡因犯事被削除官爵。二十六日任命左光禄大夫皇甫集为征西将军、仪同三司。九月十四日，皇太后驾临崧高山；十七日，还归宫中。瀛州百姓刘宣明谋反，事情败露后被杀。
冬十一月初十，蠕蠕莫缘梁贺侯豆率领男女七百人前来归降。十二月初八，司徒、任城王元澄逝世。十五日，大赦天下。皇帝下诏去除繁多淫杂的祭祀活动，焚烧众杂神像及神位。
这一年，高丽王高云死，以其世子继承其王国。
正光元年(520)春季正月初十，皇帝下诏说：“建国治民，立教为本，尊师重道，此典自旧时沿袭下来。明年二月，节和气润，祭奠孔子、颜渊，正是时节。有关部门可预先修缮国学，图饰圣贤，设置官员，准备祭品，选择吉日实施此事。”
夏四月十三日，帝下诏让尚书长孙稚巡抚北境，观察风俗。五月初九，肃宗下诏说：“朕德行寡薄，运获宝座，虽然是未明求衣，终日担心忧惧，但暗昧多缺，炎旱成灾，这都与我的责任分不开，以致我寝食尽忘。而今刑狱繁多，囹圄仍积，应广施仁惠，以济万民。有关官员可察纠囚徒，务必申直枉滥。”二十一日，肃宗下诏说：“祛灾招运，以修明政治为本，百姓是神主，实应置之首位。刺史郡守县令与朕一起共同治理天下，应该哀矜于怀，切勿自喜，视民怵惕如伤。何况今天炎旱历时，万民凋弊，而我们却不抚慰体恤穷困冤屈，按理决断众狱。可严令州郡官员，妥善安抚百姓，务必尽心尽智，还要决事果断迅速，一定要使事情公允，人神共宁，那些个不便于百姓的赋役，都要报上来，以便减除。”
秋七月初四，侍中元叉、中侍中刘腾奉迎肃宗到前殿，谎称皇太后旨意说：“魏有天下，吉星高照。高祖孝文皇帝，以英明神圣的驭天之才，迁徙都城定下江山。世宗宣武皇帝，以聪明睿智，承继帝业，拓展安定海内，但鸿勋未半，早早登仙。这样车未同轨，书未同文，大贼势头尚旺。幼主稚弱，早登皇基，无法担当起统治天下的重任，朕因此顺从群臣所请，临朝总揽朝政。帝年岁渐长，朕长久以来思谋退居，所以去年殷勤再三，陈述此意，百官群僚、内外众人都已明朕怀。但大家的意思，却让朕再勤于政，于是朕便努力于政，直到现在。从今年春天以来，旧病又发，药石加治，未能见好，夏天以来，屡屡发作，所以不堪日理万机、巨细兼顾。帝年岁已长，学识齐备，日复一日，人君的素质已经具备，足以抚治万邦，妥善和谐地治理各种事物。朕当续起前志，退居别宫，远思复子理政、身自明避之义，以自安养，实在希望众臣为百姓着想，深鉴此理。如这样，那就会上下安顺，天地清晏，魏道宏大，人神庆悦，不是件很好的事吗？”于是把皇太后幽禁在北宫，杀了太傅、领太尉、清河王元怿，总领禁卫部队，在殿中处理政务。十九日，肃宗加皇帝礼服，大赦天下，改年号，内外百官晋升官位一级。八月十三日，相州刺史、中山王元熙起兵欲诛杀元叉、刘腾，未果被杀。九月十三日，蠕蠕国主阿那瑰前来投奔。二十七日，任命太师高阳王元雍为丞相，加授后部羽葆、鼓吹、班剑四十人。
冬十月十五日，以骠骑大将军、仪同三司、汝南王元悦为太尉公。
十一月二十九日，肃宗下诏说：“蠕蠕世代雄居北方，在大漠中自成一统与华夏上国邻近相通，已经一百多年。自神鼎南底，世代相传，以至今天，虔诚的贡献虽时有违背，但边境平安，他们全心向魏，款款忠纯。现在其主阿那瑰遭逢劫难，国家分裂，亲众离析，他万里远驰，投奔我朝。悲同申、伍，忠孝足嘉。我朝应为其兴复国之师，以嘉其继绝之举，应以宾礼待他，期望其立功，恢复其地，大启河岳，可封他为朔方郡开国公、蠕蠕主，食邑一千户，赐给衣帽，加以礼车，赏给仪仗、护卫，例同亲蕃。”十二月十三日，肃宗下诏说：“蠕蠕主阿那瑰，遭逢寇乱，远来投庇，其邦分崩离析，犹无定主，而他深怀归愿、忧心切痛。启诉情切，其情哀哀。扶持复兴灭亡的政权，体恤败者，自古以来即为通典。可派国使前后三人，与阿那瑰一道；并明令怀朔都督，领精锐骑兵二千人，亲自率领，把阿那瑰送至其领土边境，令其见机行事。如蠕蠕迎候，应赐车马物品之类，务必要礼遇优厚隆重，礼饯而返；如不接受，听任其还归宫阙。阿那瑰的行装资给，交给尚书办理。”二十二日，任命司空、京兆王元继为司徒公。
正光二年(521)，南秦州氐族造反。二月十二日，假光禄大夫邴虬以抚军将军率部讨伐。二十五日，肃宗车驾驾临国子学，讲《孝经》。三月初二，肃宗幸临国子学祭祀孔子，以颜渊配祭。二十四日，右卫将军奚康生在禁宫内准备杀元叉，不果，被元叉矫诏害死。
夏四月初三，司徒京兆王元继进位太保。初五，车骑大将军、仪同三司崔光任司徒公。萧衍义州刺史文僧明率领部下归附朝廷。五月十四日，南荆州刺史桓叔兴自安昌南叛。十八日，乌苌国派使者来朝。闰月初九，居密、波斯国都派使者前来朝拜纳贡。六月初三，高昌国派使者朝贡。二十七日，勿吉国派使者朝贡。
秋七月十七日，肃宗下诏书曰：“时雨未降，禾苗形损，是我的过错，朕日夜担心忧惧，虽然勉力祭天招应，但至今仍无反应。有关部门可修按旧典，快做以下六件事：监狱中被冤枉的人火速断决；众官旷职，据情严处；鳏独困穷，宜加抚恤；役赋烦民，全加减省；贤良谠直，按时升进；贪官污吏，即地罢免，怨男旷女，务令偶配。希望克恶惩违，消除灾害。”八月初二，伏罗国派使者朝贡。蠕蠕后主郁久闾侯匿伐前来投奔怀朔镇。
十一月初一，高昌国派使者朝贡。十四日，卫大将军，仪同三司皇甫集去世。十二月初九，肃宗下诏让司徒崔光、安丰王元延明等议定服礼章法。十五日，因东益、南秦氐族人造反，帝诏让中军将军、河间王元琛讨伐他们，失利。
正光三年(522)春正月十八日，皇帝在藉田中象征性地耕田，以励农稼。
夏季四月十九日，任命高车国主覆罗伊匐为镇西将军、西海郡开国公、高车王。六月初六，肃宗下诏说：“朕以幼年，早登皇基，但不能上奉天灵，感应和气，以致炎旱连年，甘雨未降，百禾枯焦，晚种未下，将成灾年，秋熟无望。这都是我的过错，因此朕忧惧震怀。今可依旧分派有关部门，驰奔祈祝山岳及诸山川百神能兴起云雨的，务尽虔诚整肃，一定要让苍天感应降雨，玉帛牲品，有求必给。上下群官，躬身自责，断理冤狱，停止土木工程，减膳撤悬，禁止屠杀。”
秋七月初九，波斯、不汉、龟兹等国派使者前来朝贡。
冬十月八日，吐谷浑国派使者前来朝贡。十一月二十二日，皇帝到临丘处理战事。二十五日，肃宗下诏曰：“治体正处明时，前王茂轨，考定律历，是历代通常的规律。先朝各代，每每对此慨然而叹。到神龟年间，朝廷始命儒官改创疏漏的律历，回度易宪，才让律历与天象合拍。而今皇天应人，阳春将开，万物初萌，应变耳目，这是所谓魏虽旧邦，律历维新的做法。现可颁布宣明内外，名叫《正光历》。又加此是改历后的首节嘉辰，获展祝祀，神人交和，情理和合幽显，朕思考这与亿兆百姓共维此新，可大赦天下。”十二月十六日，以左光禄大夫皇甫度为仪同三司。二十七日，任命车骑大将军、尚书右仆射元钦为仪同三司，太保、京兆王元继为太傅，司徒崔光为太保。二十九日，因为牧守妄立碑颂，动不动建造寺塔；第宅丰伟奢侈，店肆商贩横行。下诏中尉严加纠摘威风，见到法规不允的事即行纠奏。七品、六品，俸禄足以代耕，也不能听其经营店铺，在城市中争利。
正光四年(523)春二月初七，肃宗追封已故咸阳王元禧为敷城王，京兆王元愉为临洮王，清河王元怿为范阳王，以礼加葬。(三月)二十三日，河间王元琛、章武王元融，都因贪污的罪名被削爵除名。二十五日，因柔然主阿那环率众侵犯边境，朝廷派尚书左丞元孚兼任尚书，为此道行台，持节抚慰他们。蠕蠕后主侯匿伐到京师朝见。宕昌国派使者前来朝贡。司空刘腾逝世。
夏季四月，阿那环俘获元孚，驱兵掠抢魏畜牧后北逃。二十三日，肃宗诏骠骑大将军、尚书令李崇，中军将军、兼尚书右仆射元纂率领十万骑兵讨伐蠕蠕，出塞三千余里，追不上敌人以后回师。
秋七月二十七日，肃宗下诏曰：“尊贵之人，年龄即是标志之一，崇奉高年的人，是先代通训。所以方叙以元老处于尊位，充国因自强不息而被朝廷挽留。虽然说七十退休，明于典故，然而因以德尚壮，允许他继续在官。而今众官之中，或年近退休，按礼当退。但是他们少年时朝廷用其才力，老了就搁置一边，朕念其旧时勤勉，实在不忍心。或在朝为官，未当外任；或因私事停官，常受考级。这样的人，虽然已年满七十，听任其治民，以终常限。或有新解郡县之职，或外佐始停，已满七十，又求重新任职的，吏部可依令不予上报。这中间有高名俊德、老成的长者，灼然显达、为时人所知晓的，不拘于此例。如若才非秀异，现任朝廷官员，依律令应当解职，可给本官半禄，以终养其身。以使辞官于朝的长者，也不对还归乡闾的人怀怨而终了余生。”
八月十一日，肃宗下诏曰：“狂暴之徒肆意施暴，凌欺窃取北方，虽然皇魏军威不断，贼徒震慑逃走，但是暴徒所经之地，当地多遭祸患，每每念此，朕心中切痛异常。可令北道行台，派使巡视检察北方，遭到寇掠的地方，饥馁无粮的，厚加赈恤，务必救济。”十四日，肃宗下诏书曰：“朕以不才，登上皇极，借光祖宗之基，身处王公之上，每每昼思夜想，考虑康抚百姓。最近以来雨旱失时，星运错纟比，政理失和，神灵变异，想到这些，朕忧心忡忡。宜诏示百司各勤其职，那些鳏寡穷疾冤滞不申的人，一并加以抚惜。像那些孝子顺孙，廉洁贞节，忠心耿耿、才学超群、独行于世的，都要向上反映，朕将亲自考察，加以提拔任命。”二十日追复已故范阳王元怿为清河王。九月十七日，库莫奚国派使者前来朝拜纳贡。肃宗下诏让侍中、太尉、汝南王元悦入居门下省，与丞相、高阳王元雍一起议决尚书们所奏的事情。
冬十一月十一日，赵郡王元谧逝世。十二日，太保崔光去世。十二月，萧衍派将侵犯边疆，肃宗下诏让假南将军崔延伯率兵讨伐。任命太尉、汝南王元悦为太保。徐州刺史、北海王元颢因贪污事发被削去官职。
正光五年(524)正月二十日，肃宗在南郊举行祭祀活动。闰二月初九，口厌哒达国派使者前来朝贡。
三月，沃野镇人破落汗拔陵聚众造反，杀死镇守将领，号称真王元年。肃宗下诏让临淮王元..为镇军将军，假镇北将军，都督北征诸军事率兵讨伐。
夏四月，高平酋长胡琛造反，自称高平王，攻打镇池以响应拔陵。别将卢祖谦打败了他，胡琛北逃。
五月，临淮王元..在五原战败，被朝廷削去官爵。二十三日，肃宗下诏，命尚书令李崇为大都督，率广阳王元渊等人讨伐北方敌人。
六月，秦城人莫折太提据城反叛，自称秦王，杀死刺史李彦。肃宗下诏让刺史元志率部讨伐。南秦州人孙掩、张长命、韩祖香据城反叛，杀死刺史崔游以响应莫折太提。太提派城民卜朝袭击高平，杀死镇将赫连略、行台高元荣。太提不久死，子莫折念生代之而立，僭称天子，建年号为天建，设立百官。十八日，朝廷大赦天下。
秋季，七月初六，肃宗诏命吏部尚书元修义兼任尚书仆射，为西道行台，率领众将西讨。初十，复河间王元琛、临淮王元..本封。
都督崔暹在白道失利，大都督李崇率部还驻平城，因其帐中长史祖莹截获吞没军用物资被免除官爵。二十八日，念生派其都督杨伯年、樊元、张朗人攻打仇鸠、河池两个戍镇，东益州刺史魏子建派将领尹祥、黎叔和打败他们，砍下樊元首级，斩杀敌人一千多人。
这个月，凉州禁卫军将领于菩提、呼延雄绑起刺史宗颖，据城反叛。
莫折念生派其兄高阳王莫折天生率兵下陇向东侵犯。
八月十六日，元志在陇东大败，退守岐州。十九日，肃宗下诏曰：“嘉贵赏劳，是圣明之主的常德；恩及旧绩，是警示后人的常规。太祖道武皇帝顺应天期，拨乱返正，大造华夏；世祖太武皇帝继承洪绪，光大王业，亲率六师，扫清恶秽；诸州城镇人，充当士卒，南征北战，戎马倥偬，备受劳苦。等到显祖献文皇帝，自北向南，淮海一带百姓归诚大义，因此他分划强族，派将镇守方镇。高祖孝文皇帝，远遵盘庚，将迁都嵩山洛水之间，思求遏抑北疆，开拓南境，选任良家豪杰，增加北守力量，北戎所托，实倚此辈。先帝因他们忠心不二，方加酬劳赐锡，逢宛、郢烽火烟起，朐、泗告警，军旗频动，连年动兵，这种恩宠方才停止。到了今天，怨怒反叛兴起，很大程度上是由于此。朕妄承皇统，安抚统治天下，调应天时，施布惠政，谋求广播恩泽，现在应追述这些人前番恩忠，追嘉其功。各州镇俘虏，只要原来不是犯罪发配的犯人。都免其为平民，镇改为州，依旧时称号。这些人世代习于战伐，大多是刚劲勇猛之徒，今天既然受到甄选拔任，应思报效国家。可间歇开拔前去征讨沙陇。当让人齐心协力，奋勇当先，这样，妖党狂丑之人，必可被荡除殆尽。士卒冲锋陷阵，立下战功的，自依常式嘉赏。”二十日，南秀容牧子于乞真反叛，杀害太仆卿陆延。别将尔朱荣讨伐平定了叛乱。