所谓“灭活疫苗”，其实就是一种被杀死的病毒，将其输入人体，既不会使人染病，又可以使人体产生抗体，抵御病毒入侵，由于“灭活疫苗”是被充分杀死的病毒，所以就不存在毒力恢复的危险，目前临床上一般认为“灭活疫苗”具有更好的稳定性，安全性有充分保障，被绝大多数人选择使用。
而“减毒活疫苗”则是一种活疫苗，是人为地将病毒的有害成分杀死，保留抗原成分，人体接种后可获得自然免疫力，接种次数少，但副作用较大。比如从价格上比较，“甲肝减毒活疫苗”在20元左右，而国产灭活疫苗一支90元左右，进口的价格在140元左右。而从保护期长短上比较，“甲肝减毒活疫苗”的保护期为5年，而“灭活疫苗”的保护期是20年。
如果选择“甲肝减毒活疫苗”只需要接种一针，若选择“甲肝灭活疫苗”则要接种两针，且两针之间需要间隔6个月时间，一般来说按照程序接种完之后8周左右便可产生抗体，获得免疫力。