医生根据小儿年龄、营养状况、一般状态、先心病的类型是否有合并症等，来选择手术时机，但总的来说（4--6）岁为宜。房间隔缺损和室间隔缺损病人，指缺损在4―5mm以下，临床无症状者，一般无须手术治疗，指缺损在5mm以上者，病人在婴儿时期可无临床症状，但随年龄增长而症状渐趋明显，到成年人加重，在婴儿期可合并上呼吸道感染、肺炎及心功能不全，故应及时手术修补。动脉导管未闭患儿，应根据动脉导管类型和分流量多少来决定手术。动脉导管口径小、分流量小者，在代偿期无临床症状，往往体检时偶尔发现，一岁以内可严密观察，如果一岁以后动脉导管仍未关闭，则应在适当年龄作手术结扎或切断治疗，大型导管分流量大，临床症状明显，易发反复呼吸到感染、肺炎及充血性心功能不全，主张在药物控制后进行手术，不受年龄限制。