治疗：一般而言，淋病性双球菌感染会同时合并其他器官发炎，因此除了用生理盐水冲洗宝宝的眼睛之外，还需要给予抗生素治疗，维持1-2周的时间后，再次了解宝宝的身体状况，以控制宝宝的淋病性结膜发炎状况，同时避免情形严重化。
披衣菌结膜炎：
原因：若父母的**器遭到披衣菌感染且并未及时接受治疗，或者没有治愈，则宝宝在出生经过产道的时候，虹膜可能会受到披衣菌的感染，从而形成披衣菌结膜炎。因此父母应该在产前就先行检查**器是否感染了披衣菌，若被感染，要尽快接受治疗。披衣菌结膜炎的症状会在宝宝出生后5-14天出现。
症状：披衣菌会使宝宝的眼睛出现黄色化脓性分泌物，如未接受完善的治疗可能会导致结膜疤痕、角膜血管翳等并发症。情形严重得时候，甚至可能造成宝宝失明，新生儿则可能出现肺炎或是其他的呼吸道疾病。
治疗：建议先取眼睛周围分泌物的样本做细菌培养，以便确认是否属于披衣菌结膜炎（根据结果确认治疗方式）。治疗披衣菌结膜炎会用抗生素、口服红霉素以及局部使用四环霉素眼药膏持续治疗，治疗时间也需长达7-14天。
急性结膜炎：
原因：引起急性结膜炎的主要原因为病毒（如腺病毒、疱疹病毒、流行性感冒病毒等），或细菌（如葡萄球菌、链球菌、流行性感冒杆菌等）感染。但也可能因为眼眦赘皮（尤其是亚洲人），婴幼儿的眼皮较为肥厚，容易把睫毛倒推进眼内而反复摩擦、碰触到角膜，这样婴幼儿就会因为不舒服而常常揉眼睛，因此造成急性结膜炎。
症状：因病毒或细菌感染而引起的急性结膜炎会有眼睛刺痛、发红、异物感及大量的分泌物（病毒性结膜炎的分泌物为水状，细菌性结膜炎则是粘稠的化脓分泌物）。大量的分泌物容易造成上、下睫毛粘到一起，或是分泌物附着在眼球表面而使得视线模糊，也有可能导致结膜下呈现点状或者片状的出血的情形。
治疗：一般皆以症状治疗为主，初期的急性结膜炎可使用抗菌剂或药膏涂抹，并进行持续性观察，需不间断维持约2周的疗程。若症状发作且感到不适的时候，可冷敷病眼5分钟左右，每日2-3次，有助于不适症状的减轻。在分泌物不多的时候，即可多加留意并以干净的湿棉签清洁眼睛及睫毛上的分泌物。由于急性结膜炎的的传染力相当强，因此建议对患者应隔离2周以上并保持环境卫生，以免宝宝的症状严重化或者传染给他人。平时帮宝宝养成勤洗手且不揉眼睛的习惯，避免用沾染到细菌的手碰触眼睛或是接触其他物品，导致大规模的传染扩散。