发病原因
童年情绪障碍产生原因较多，多数学者认为与心理因素和易感素质有关。
1.心理社会因素 儿童的生活较成人单纯，但在家庭和学校等环境中，也会遇到各种心理社会方面的应激因素，如父母的过分保护或过分苛求、态度粗暴等家庭及学校不恰当的教育方式，意外生活事件的惊吓、身处矛盾无法解决等均能对儿童心理活动造成不良影响，引起过分而持久的情绪反应。
2.遗传因素 父母将遗传基因传给子代，子代不仅继承了父母的体形外貌，也包括个性和情绪反应特征。该病的发生多是由于患儿具备遗传性易感素质与人格类型(如情绪不稳定和内向型性格的人)，加上外环境作用于易感素质的结果。据报道，双生子同病一致率占47%，患儿家族中有相同病者占16.9%。
3.儿童时期患严重的躯体疾病 在疾病治疗的过程中儿童容易产生情绪问题。
发病机制
根据童年情绪障碍中不同病症具体叙述如下：
1.儿童离别焦虑症
(1)欲望得不到满足：按照Freud的心理动力学理论，当个体潜意识中出现心理冲突时则会表现为焦虑，这种冲突是由个体对欲望的需要和现实生活对欲望的限制造成的，是人格结构中“超我”与“本我”斗争的结果。
(2)遗传因素：焦虑症患儿父母和同胞中约15%也有焦虑表现，MZ的焦虑共病率可达50%。
(3)亲子关系不良：Bowlby(1977)认为，正常情况下，父母应给子女以安全而温暖的环境，但又不能使他们依赖这种环境。而亲子关系不良时则表现为一方面对子女态度冷淡、苛责，另一方面又让子女依附于自己，使子女处于一种无所适从的矛盾境地。
(4)生活事件：在出现离别焦虑之前，往往会有生活事件作为诱因，常见的生活事件有与父母突然分离、不幸事故、亲人重病或死亡、在幼儿园受到挫折等。
2.学校恐惧症的病因
(1)亲子关系不良：早在20世纪70年代，Bowlby就已经注意到了亲子关系的异常可以导致学校恐惧症的发生。这种异常的亲子关系往往表现为：母亲多为慢性焦虑患者，总希望把子女留在家中与自己做伴;儿童害怕当自己去上学时，父母会遭遇到不幸，因此自己要求留在家中;儿童担心自己离开家庭时会受到意外伤害，宁肯留在家中;母亲担心儿童去上学会发生不幸事故。
学校恐惧症和儿童离别焦虑障碍存在着十分密切的关系，两者都可能是亲子关系不良的结果。学校恐惧症患儿不愿意上学现象，更多体现在不愿与母亲的分离，基本问题是与母亲分开后表现出来的严重焦虑症状。
(2)学习中遇到挫折：大部分学校恐惧症患儿学习成绩好、自尊心较强，当他们在学校受到挫折或者学习上出现失败时，自尊心受到伤害，产生强烈的情绪反应和痛苦体验，患儿不愿意面对这种困境，不想再次尝试这种痛苦体验，而采用回避的应付方式待在家中。此时，父母不适当的处理方式会加剧症状的严重性：①儿童的行为在家中得到保护和支持;②父母对儿童的不满和害怕采取附和、同情的态度;③父母对儿童的外出、上学表现出焦虑反应时，都可以使儿童的恐惧上学行为得到强化，学校恐惧症状越来越牢固。