引起小儿鼻窦炎的原因很多，以下是最常见的三个原因，主要都是感冒、鼻炎等疾病处理不当，让病情加重从而发展为鼻窦炎。
1 、感冒
这是最常见的原因。小孩平均每年感冒6- 8次，每次感冒有5 -10 %会合并鼻窦炎，而大人只有0.5 -1 % ；当小朋友感冒没有完全治愈的话，就很有可能会变成鼻窦炎。
2 、过敏性鼻炎
因为小儿的过敏性鼻炎多半是遗传所致，因此从小就患有过敏性鼻炎的人非常多，根据统计，父母都有过敏性鼻炎的，小孩约有80 %以上或有过敏性鼻炎，父亲或母亲一方有过敏性鼻炎的，则小孩有50 %会遗传，而小孩的过敏性鼻炎约有50 %会并发鼻窦炎。
3 、免疫功能，鼻窦功能尚未成熟
年纪越小，鼻窦炎的机率就月大；七岁以上，因为免疫功能以及鼻窦功能渐渐趋于成熟，鼻窦炎发生的次数也就越趋减少；这就是为什么小儿感冒容易并发成为鼻窦炎，而大人较不会的原因。
治疗方法：
小儿鼻窦炎的病因，病理、症状诊断和治疗与成人不尽相同。据文献报道，儿童平均每年罹患6～8次以上呼吸道感染，每次发病都可累及鼻窦，多数可自行痊愈，约5%的病人可形成慢性鼻窦炎。而冬季正是上呼吸道感染的高发季节，这使得儿童倍受鼻窦炎的威胁。
1、急性小儿鼻窦炎
(1)抗生素：正确而且适量的抗生素使用，是治疗急性鼻窦炎的不二法则。而急性鼻窦炎的抗生素疗程至少要10～14天，若症状未缓解，则需再延长两周。因为细菌在很里面的位置，抗生素要在血液浓度达到一定的效果，才有办法发挥治疗效果，越深度的感染，需要的时间则越久。
(2)排脓：排脓除了具有立即改善鼻塞情况的效果之外，由于小朋友鼻腔、鼻窦的连通性比大人大，经由鼻腔的抽吸能有效的帮助鼻赛排脓，特别在那些还不会擤鼻涕，或不愿意擤鼻涕的小朋友身上。
(3)鼻黏膜消肿：除了药物的辅助(如“去充血剂”)之外，鼻腔局部的蒸气治疗和鼻腔灌洗，都能帮助栘除黏液，对鼻黏膜也有消肿的作用。
2、慢性小儿鼻窦炎
(1)关键增强自身整体抗病功能，用正气中药，治好了才不会反复发作。
(2)用清热排毒，养阴化痰中药。
(3)用补脾胃的中药，打开胃口。