疗程不应少于3周 支原体肺炎并不难治，关键是治疗要规范、恰当。 治疗此病使用青霉素类或头孢菌素类效果不佳，应首选大环内酯类药物，包括红霉素、罗红霉素、阿奇霉素等。
在疾病早期，病儿发热明显时，最哈静脉滴入红霉素，待热退后可改口服红霉素、罗红霉素或阿奇霉素。如静脉滴入红霉素时，病儿的肠胃道反应(腹痛、恶心、呕吐、厌食等)严重或出现皮疹等过敏反应，可改滴入阿奇霉素、克拉霉素等。
疗程(静脉滴注加上口服药物的总时间)一般需达3~4周;若停药过早，易使病情迁延不愈。 另外，重症病儿如高热不退、喘憋明显、肺部有异样表现时，还可短程使用糖皮质激素(如地塞米松等)。