一、心率改变

分子类型的改变会发生在运动员的心脏里，这就会造成他们患上与心脏相关的健康问题。运动生理学研究发现：终身从事耐力项目的运动员其心肌的纤维化率很高，特别是他们的心脏细胞也会硬化。这种硬化会造成心脏骤停，引发心律不齐。每周跑步持续超过 25英里（约合40公里）的跑步者其死亡风险相当于那些不锻炼的人。

二、肌肉骨骼改变

在运动过程中，肌肉和骨骼会不可避免的遭到损伤，它们需要24-48小时的休息才能完全恢复过来。如果肌肉的疲劳感超过了48小时，这就意味着锻炼者的生理功能受到了过度挑战，也表明他的肌肉和能量存储没有有效的恢复过来。美国约翰霍普金斯大学医学院的研究者认为：锻炼后的慢性疲劳感表明锻炼者训练过度了。

三、免疫系统改变

运动过度会损伤免疫系统的功能，因为身体需要与疲劳感和不充足的肌肉恢复相斗争。研究表明：超过90分钟的高强度耐力运动会让运动员在锻炼结束后的72个小时内容易患上疾病，这是因为剧烈运动会暂时性地降低免疫系统的功能。

四、激素改变

训练过度会影响到激素的分泌功能。运动员会体验到皮质醇和肾上腺素分泌量的增多，这两种激素也被称为应激激素，它能升高血压和胆固醇含量，从而抑制免疫系统的功能。训练过度还会通过增加两种激素-肾上腺素和去甲肾上腺素的分泌量而抑制食欲。热量摄取不足，就会放缓恢复速度，让训练过度的不适症状更为严重。

五、睡眠改变

运动过度会对身体施加压力，导致皮质醇含量上升。皮质醇和其他激素含量的升高会影响到睡眠习惯。皮质醇的功能决定了睡眠模式，所以，如果皮质醇含量在就寝时过度升高，就会妨碍睡眠质量。