流行病学
百日咳杆菌病原体是一种微小的不能运动的革兰氏阴性球杆菌。传染是通过吸入病人喷入空气中的百日咳杆菌而引起的，特别是卡他期和痉咳早期传染性最大。很少通过接触污染的物品传染。病人一般到痉咳第3周后即无传染性。
百日咳是遍及全世界的地方性流行病。在美国，80年代末出现增加趋势。就某一地区来说，每2~4年流行1次。任何年龄均可发病，但6个月以下的乳儿占38%，5岁以下占71%，最近发现青春期的青少年和成人是本病的主要来源。一次发病不能提供终生自然免疫，但第二次发病，往往比较轻，常不被发现。
副百日咳是由副百日咳杆菌引起的，其临床表现难以与百日咳区别，但一般比较轻，很少会引起致命。
症状和体征
潜伏期平均7~14日（最长3周）。百日咳杆菌侵犯鼻咽部，气管，支气管和毛细支气管的粘膜，引起粘液性分泌物增加，开始时稀薄，以后逐渐变粘稠。整个病程若无并发症约6~10周，可分为3期：卡他期，痉咳期和恢复期。
卡他期在不知不觉中开始，通常有喷嚏，流泪或鼻炎的症状，食欲减低，烦躁不安及令人烦恼的夜间不停的干咳，并逐渐转为百日咳。此期发热较少。
10~14日后咳嗽转为痉咳期，咳嗽加剧而且更频繁，在5~15次以上的一连串咳嗽后跟着出现高音调吸气，即一种急促的深吸气。在几次正常呼吸后紧接着又出现一次阵发性咳嗽，如此周而复始。在阵咳期间或之后，可能吐出大量粘稠分泌物（通常被婴儿和小儿吞咽或经鼻孔排出大量泡沫）。阵发性咳嗽后，由于浓稠的粘液堵塞常出现呕吐，具有特征性。对婴儿来说，窒息发作（有或无发绀）可能较高音调吸气更为常见。
一般在4周内进入恢复期；痉咳次数逐渐减少或严重程度减轻，呕吐减少，病儿看上去感觉逐渐好转。本病病程平均为7周（3周~3个月）。几个月内可能由于上呼吸道感染的刺激而重新出现阵挛性咳嗽。
白细胞计数一般为15~20X109 /L（15000~20000/μl）但也可正常或高至60X109 /L（60000/μl）；淋巴细胞占60%~80%。
并发症和诊断
最常见的是呼吸系统并发症，包括婴儿窒息。婴幼儿百日咳死亡病例大部分是由于支气管肺炎引起的。支气管肺炎也是老年患者的常见并发症，对任何年龄组都有致命危险。阵挛性咳嗽期间，由于胸内压升高会引起肺间质性气肿，皮下气肿和气胸。体质虚弱病儿会发生支气管扩张和肺气肿。粘液栓子堵塞细支气管会引起肺不张。原发性肺结核也可能因为同时发生百日咳而扩散。婴儿常发生惊厥，但在年长儿少见。脑实质，眼，皮肤，粘膜出血可能是由于严重的阵挛性咳嗽以及由此引起的缺氧所造成的。脑出血，脑水肿或中毒性脑病会导致痉挛性麻痹，智力迟缓或其他神经疾患。舌系带溃疡可能是由于阵挛性咳嗽时舌外伸与下门齿摩擦所致。偶尔会发生脐疝和脱肛。并发中耳炎者常见。