治疗护理：

胎儿酒精综合症是不能治愈的，因为中央神经系统受损是永久的，不过治疗仍是可能的。因为中央神经系统受损、征状、次级障碍及需要会按不同人而有所不同，并没有一种统一的治疗方法。相反，全面及基于病人需要的多模型方式才能有效。有几个治疗的模型现正被使用，很多研究认为多个治疗方法可以改善负面的影响。

1、药物治疗：

传统的医药治疗(即精神药品)经常被使用，因为很多胎儿酒精综合症的症状会被误会成其他障碍或与之重叠，最明显的有注意力不足过动症。例如一个患者是怠慢的、没有完成家课及不能维持坐下等都会很易被诊断成为注意力不足过动症，尤其是当病人未有进行胎儿酒精综合症的诊断。一般的做法是转介往小儿科医生，小儿科医生可能会建议尝试使用利他能。

药物在治疗胎儿酒精综合症是很重要，但必须与其他治疗方式一拼使用，以应付多种的障碍。

2、行为疗法：

由于胎儿酒精综合症患者的学习系统受损，行为治疗并非经常有效，或长时间有效，尤其是因胎儿酒精综合症引起的或恶化的重叠障碍。埃尔菲·艾恩 (Alfie Kohn)指奖励及惩罚在一般情况下可能有短期效用，但在长期并不成功，这是由于这方式没有考虑满足(即值得学习)、共同体(即安全及合作学习的环境)及选择(即作出选择或是跟从指示).虽然这些元素在治疗上有一些用处，但它们本身却不能提升表现。而艾恩对行为治疗的挑战显示有一些重要的因素是在学习理论之外，这支持了更多模型的治疗方式，如在倾向性模型及神经行为方法等。

保健：

酒精是致畸胎物，唯一肯定可以防止胎儿酒精综合症的方法是在妊娠期间避免喝酒。有些研究指小量的酒精并不会对胎儿造成风险，当然完全没有吸入酒精能保证绝对安全。