胚胎停止发育有的是胚胎本身发育不好，自然死亡，有的是激素不足以支持胚胎发育，造成死亡。或宫腔畸型使胚胎无法生长。一些疾病如糖尿病、甲亢等也会使胚胎停止发育。
造成胚胎发育异常的原因有遗传因素、有无感染、是否接触放射性物质、有毒的化学制剂、是否吃了孕期禁忌的药物、高温、过度受刺激等等。胚胎自身有缺陷或在发育过程中受不良因素影响停止了发育。 这种情况保胎是没有意义的。
胚胎停育的病因不是很明确，可能的原因有：孕妇接触或感染了不利于胎儿发育的因素、母儿双方免疫不适应或血型不合等。如果是胎停育而流产，最好能多隔一段时间再考虑妊娠，至少半年以上。准备怀孕前女方做一下相关检查。如风疹病毒、弓型虫等等。