竖笛由于气道及管腔的内径较窄小，特别是新乐器吹奏不久后，在气道内会出现水珠凝结现象，从而影响正常的发音，使声音嘶哑、发闷。初学者由于气息控制的能 力较弱，吐舌的方法不当，有时也会将口水带入气道，甚至会有水珠堵塞高音孔而影响演奏。出现这种现象后，可用一手指按住笛头上的窗孔用力吹气将气道内的水 珠冲下去，然后用专用的擦杆带上一小块软布伸进管腔内来回拉几次，把积水擦干。 每次演奏完后，可用清水冲洗竖笛，擦干后放入专用的盒子或袋子。万一气道内有杂物时，只能用水冲洗或用强气流冲击使异物排出，不可用金属物去捅。
笛头窗孔内的哨舌锐棱是发音的关键部位，非常娇嫩易损，对它的保护至关重要。由于哨舌锐边比较薄，极易碰坏，所以在拆卸清洗时须特别小心。
为了保持插接口的紧密度，应尽量减少拆卸次数，可在接口处涂抹少许凡士林油，以减少磨损。拆卸时应慢慢地旋转着分解乐器，避免用力过度，强行拆装。不要用汽油、酒精等化学制剂擦洗竖笛，以免其变质发酥。