小儿便秘大多与小儿的饮食结构、喂养方法及生活习惯有关。如果经常出现便秘，应考虑消化道畸形引起。
婴儿便秘时，原则上不要用泻药，必要时可临时用甘油栓或开塞露。如果新生儿因消化道畸形引起便秘，需要到医院检查，进行手术治疗。
吃奶的婴儿便秘时，可多加些糖，并添加橘子汁、白菜汁和蜂蜜水等，正在断奶期间的婴儿便秘时，在增加辅食时，除了考虑高营养的蛋类、瘦肉、肝和鱼类外，还要增加纤维素较多的蔬菜、水果以及粥类。大些的孩子便秘时，可增加一些较粗的五谷食品，牛奶改换为鲜牛奶。同时，增加体育锻炼。
消除便秘，要从改进小儿的食物结构、训练排便习惯入手，3个月以上的婴儿，每天要有意识地培养小儿坐盆或用排便小椅。通常在清晨哺食之后，训练其按时排便。