新生儿发热可因疾病所致，特别是各种病原体引起的各种感染性疾病，包括：肺炎、脐炎、败血症、化脓性脑膜炎以及各种病毒感染性疾病等。

二周以上的体温升高为长期发热。

反复发作或迁延的发热应首先考虑各种感染如泌尿道感染、中耳感染、肝胆感染、结核感染、风湿热、肠道病毒所致感染、骨髓炎、肝脓肿、败血症等。(在新生儿或经过免疫掏治疗的患儿，败血症往往缺乏典型表现，如脾大、中性血细胸增高)以及霉菌病等。幼儿长期发热可由于神经母细胞瘤引起。

此外，慢性咽炎、扁桃体炎或鼻窦炎往往引起长期低热，应加注意；在流行地区，应考虑伤寒、副伤寒、布鲁氏菌病、疟疾、血吸虫病、肺吸虫病、钩端螺旋体病，旋毛虫病等。

长期发热的少见病应想到结缔组织病，如：类风湿病、红斑狼疮、皮肌炎，还应考虑血液系统疾病。