体质性肥胖是肥胖妇女不孕的最主要根源。其原因与激素水平的变动有关。

过多的脂肪，将导致体内雄激素转变为雌激素，造成雌激素生成量增多。研究发现，女性肥胖者由这种方式生成的雌激素量为正常体重者的2~5倍。

此外肥胖还可改变雌激素的代谢途径，生成较多的有生物活性的产物——雌三醇。

以上两种方式生成的女性激素不像卵巢分泌的雌激素那样具有周期性活动，也就不能诱发排卵，月经则可能稀少、淋漓或量多。研究发现，肥胖妇女的月经紊乱发生率（多为月经稀少）可达56.2%，而消瘦妇女只有38.8%。

再则，肥胖妇女血内有生物活性的雄激素水平过度增高，过多的雄激素亦可抑制卵泡发育，引起闭经或不孕。