苦瓜有清热解毒、明目祛暑、清肝降火作用。适于暑热烦渴、口苦目赤、痈肿疮疖、尿痛尿少等症。
苦瓜种仁中可提取出α-苦瓜素和β-苦瓜素，可干扰癌细胞的正常代谢，达到抗癌目的。苦瓜种籽中含有胰蛋白酶抑制剂，可抑制癌细胞分泌的蛋白酶，阻止其生长。苦瓜汁中有类似奎宁的蛋白成分，可调解细胞免疫功能，提高巨噬细胞的吞噬能力。
苦瓜特有的苦味可刺激胃液分泌，提高食欲，促进消化。苦瓜的提取物具有抑制多种细菌的功能，包括革兰氏阳性球菌、杆菌等，故成为天然广谱抗菌食品，适合眼部、泌尿系统感染或有疖肿的患者食用。苦瓜中还有较多的降血糖成分。
苦瓜吃法颇多，凉拌、清炒、烧、煎均可。苦瓜性寒，脾胃虚寒、腹痛泄泻者当慎。
与苦瓜有关的食疗方介绍如下：
清热消暑方：用于因暑热伤阴引起的烦渴引饮、汗出恶热、小便短赤等症。苦瓜两个，洗净，剖开去瓤，用削果皮刀纵行削成薄片，装入碗内，倒入可乐饮料没过苦瓜，稍加白糖，置冰箱冷藏室内10小时以上取出吃苦瓜，清脆甘凉可口。
增进食欲方：用于因胃有积热引起的食欲不振、胃热呕逆、大便秘结等。猪肚一个，去脂膜翻洗干净，开水焯过，切丝慢火炖烂，苦瓜2～3个去瓤切块加入，酌加调料，分次吃菜喝汤。
清心泻火方：适于因上焦实热、心肝火旺引起的头痛头晕、壮热目赤、牙龈肿痛等症。家鸭一只去内脏，慢火煲汤约2小时，苦瓜及冬瓜各500克，切块加入，酌加盐、味精、香菜等，吃菜喝汤，可清心泻热、利尿通淋。
苦瓜虽苦能解毒，清心凉血又明目；肝火上亢何须药，凉拌苦瓜把热除。