1.非手术疗法
(1)纠正便秘，养成良好的排便习惯。
(2)治疗慢性咳嗽和腹泻，去除腹内压增高的因素。
(3)防止脱垂黏膜受损：直肠脱出后需立即托回，防止脱垂黏膜受损，复位后可用纱布卷堵住肛门，也可用丁字带压紧肛门以防脱出。
(4)局部注射法：用5%～10%酚甘油经肛门注射于直肠黏膜下，使黏膜与肌层粘连;或经肛周作直肠周围注射，使直肠与周围组织粘连固定。
在儿童多为部分脱垂，不严重，一般可采取非手术疗法。引起脱垂的一些原因如营养不良、慢性咳嗽、腹泻、便秘等都应予以治疗，不少患儿经治愈这些疾患后，直肠脱垂可以自愈。此外还可练习在平卧位排便，即使蹲位排便也嘱病人不宜过分用力，必要时可服一些缓泻剂。便后如有脱垂应即时复位，然后用胶布将两侧臀部拢紧固定。如经上述治疗不见效时，可采用硬化剂注射疗法，例如可用5%石炭酸花生油按前、后、左、右四个点注射至直肠黏膜下，每点注射1～2ml。必要时1～2周后可重复注射一次。如病期较长，肛管括约肌明显松弛，上述疗法无效时，可采用肛门周围皮下埋入支持环的简单手术。这种手术可在局麻下进行，在肛门前后各作一小切口，用血管钳环绕肛门游离皮下，使两切口相通，然后穿入一金属线，环绕肛门作成环状，在肛门后方将两端拧紧以缩小肛门，至能容一指通过即可。为了加强其作用，还可在其上方再环绕一根金属线。金属线可在术后2～3个月取出，时间过久金属线有折断或穿透肛管壁的可能。为了避免这些缺点，也可选用纺绸带或其他合成纺织品以代替金属线，这类纺织品组织反应很小，可以不必去除。
儿童直肠脱垂多可自愈，以非手术治疗为主，成人直肠脱垂经非手术治疗可减轻症状，一些部分脱垂可以治愈。
2.手术疗法
成人完全性直肠脱垂以手术治疗为主，手术方法较多，选择上存在争论。按手术入路分为经腹、经会阴和经腹会阴手术。全身情况好的病人采用经腹术式，老人及高危病人作经会阴术式治疗。根据病因及病理改变不同，可有很多术式可供选择，大致手术方法为：消除直肠膀胱或子宫陷凹，修补加强骨盆底和肛管括约肛，提高、固定直肠，切除部分冗长的直肠、乙状结肠。很多手术是几种方法的结合。目前常用手术有以下几种：
(1)直肠悬吊固定术：
①Ripstein手术(Teflon悬吊术)：经腹切开直肠两侧腹膜，将直肠后壁游离至尾骨尖，向上牵拉直肠，将宽5cm的四氟聚乙烯(Teflon)网带围绕直肠上部，两端固定于骶岬下方的骶前筋膜及骨膜上，将网带边缘缝合于直肠前壁和侧壁。手术要点为提高盆腔陷凹，手术简单，不切除肠管，复发率和死亡率低。该手术目前在美、澳等国较流行，但仍有一些并发症，如便秘、肠腔狭窄和悬带脱落。Gorden综合文献报道1111例，复发率2.3%，并发症率16.5%，Tjandra(1993)在27年内用该手术治疗完全性直肠脱垂142例，随访1～15年，复发率为8%。