新生儿脑脊液的正常值是有争议的，并与年龄有关。总的来说，低出生体重儿在生后4周内20个细胞/μl（多形核白细胞可达1/2），蛋白质定量为160mg/dl，糖水平为50mg/dl（2。8mmol/L）是正常值的高限。对足月儿这些高限为10个细胞/μl（多形核白细胞可达1/2），蛋白质定量为80mg/dl，糖为50mg/dl（2。8mmol/L）。由于脑脊液糖含量很大程度上依赖于血糖浓度，正常情况可低至20~30mg/dl（1。1~1。7mmol/L）。血糖浓度应在腰穿前测定，这样可以确定脑脊液糖/血糖的比值（＜50%为异常）。
应怀疑对适宜的抗生素治疗无反应的任何新生儿存在脑室炎。有脑室穿刺液白细胞计数＞100/μl，革兰氏染色阳性或培养阳性，脑室压力增高和脑室扩大时可作出诊断。当新生儿对治疗无反应，应怀疑脑室炎或脓肿，MRI或CT造影扫描对诊断有帮助。
预后
预后是根据出生体重，病因和临床表现决定的。未经治疗的新生儿脑膜炎死亡率高达100%。即使经过治疗，革兰氏阴性菌的新生儿脑膜炎死亡率为20%~30%；革兰氏阳性菌（如GBS）的新生儿脑膜炎死亡率也为10%~20%。某些坏死性脑膜炎或脑脓肿病例，死亡率高达75%。存活的新生儿脑膜炎病例20%~50%留有神经系统后遗症（如脑积水，听力丧失，智力发育落后）。由革兰氏肠道阴性菌引起的新生儿脑膜炎的预后更差。
预后部分取决于在诊断时通过菌落计数而得到的在脑脊液中出现的细菌数量。脑脊液培养阳性持续时间与并发症直接有关。总体来说，GBS脑膜炎经抗生素治疗24小时脑脊液无菌，革兰氏阴性杆菌脑膜炎，脑脊液细菌阳性可持续3天半。
GBS脑膜炎的死亡率比早发型GBS败血症显著为低。
治疗
主要目标是快速达到脑脊液无菌。细菌消失的速度与对病原菌的抗生素在脑脊液中的杀菌浓度有关。达到最小杀菌滴度10倍时脑脊液可以无菌，常用于治疗新生儿脑膜炎的抗生素的脑脊液水平/血清水平不同比率见表260-8。