在西柏坡期间，中央集体办公会由周恩来主持，胡乔木作为新华通讯社社长出席会议。
新中国成立后，周恩来出任政务院总理兼外交部长，胡乔木是新闻总署署长，仍任毛泽东秘书。因为工作关系，两人接触更多了。
1951年1月8日，胡乔木因劳累过度，突然胃出血，吐了一大盆子血，急送北京医院抢救。北京医院院长、外科专家周泽昭亲自为胡乔木作检查，是胃溃疡引起的胃穿孔大出血，必须立即开刀。周恩来闻讯，立即赶来，召集医生会诊，卫生部副部长傅连暲也来了。有人担心胡乔木长期超负荷工作，身体很虚弱，怕经受不了动大手术。周恩来征询他夫人谷羽意见，谷羽表示同意“开刀”。胡乔木手术后出现了意外，胃与肠粘连，需要第二次开刀，这下胡乔木可受不了了。周恩来闻讯，又一次来到北京医院，听取医生们意见，他问医生：“除了再开刀之外，还有没有别的办法？”经过医生们的研究，最后决定不动手术，吃药、打针治疗。胡乔木手术后，周恩来根据毛泽东的指示，特地派人将颐和园的谐趣园整修好，让他和谷羽住进去休养。
1954年3月8日，胡乔木完成《中华人民共和国宪法》草案第四稿后，右眼患了中心性视网膜炎，又一次住进北京医院，周恩来因忙于出席日内瓦会议的准备工作，不得分身，特地托人传口信，建议胡乔木去苏联莫斯科克里姆林宫医院治疗。随后胡乔木赴苏，当年8月才回国。胡乔木眼疾日渐康复，他又忙碌起来，协助周恩来起草中华人民共和国第一届全国人民代表大会第一次会议上的《政府工作报告》。这年9月16日，周恩来致函胡乔木：
“现将政府工作报告草稿第二、三两部分付印，约好于今（17日）早送你。第二部分还有些材料可以取用。第三部分从政务院政治法律委员会取来，可用的材料甚少，也不好删改，你最好不要多用时间去看它，因为改写的报告，在政权一段宜短，以重写为妥。
我很不安。原想由我先将各方面初稿汇集改好后，再送你修改，不料忙了两周，竟不能终篇，而且误了时间，给你造成极大困难，这是我工作方法上的错误。严格说，也是思想上的错误，现在时间有限，请你与伯达同志一商，按照主席指示，如能重写就重写，不要受原稿的任何拘束，也许更便利些。如何，请酌。”