药物治疗
如果生活方式干涉失败，应由专科医师进行评价。专科医师应评估共存疾病的范围和程度，考虑包括药物的治疗方法。当前，以增加能量消耗（刺激）、抑制热量摄入（抑制食欲）、限制营养素吸收和/或调解胰岛素生成或作用来设计药物干涉。
刺激性药物 使用代谢刺激剂治疗肥胖在历史上发生过许多波折。曾经认为许多抗肥胖药物是安全和有效的，即甲状腺激素、二硝基苯酚（dinitrophenol）、安非他明（amphetamine）、氟苯丙胺（fenfluramine）、右旋芬氟拉明（dexfenfluramine）、苯丙醇胺（phenylpropanolamine）、麻黄类（ephedra），后来因为这些药物比较危险，在某些情况下引起危及生命的并发症而放弃使用。
在摄取适度低热量饮食的青少年的一项短期实验中，将咖啡因加麻黄素与安慰剂进行了比较，虽然药物治疗受试者减去了更多的体重，但副作用过多。因此，不能推荐这些药物。
抑制食欲的药物 目前唯一批准肥胖青少年（16岁以上）使用的抑制食欲的药物是西布曲明（sibutramine）结合热量限制和全面家庭行为计划，在最初的6个月期间，西布曲明使43名肥胖青少年BMI减小了8.5±6.8%，而39名安慰剂处理的受试者减少了4.0±5.4%。在后来6个月的治疗中，体重未再减少。但以西布曲明治疗的43名受试者中的19名出现了轻微的高血压和心动过速，迫使减少了药物剂量，其中5名血压持续升高而终止了药物应用。其它潜在的严重并发症包括失眠、焦虑、头疼和抑郁。
抑制食欲药物应当是饮食和运动计划的补充，决不能替代饮食调节和运动。这些药物对于总体重有适中的作用，在个体之间的反应存在相当大的差异。应用抑制食欲药物可在开始治疗后4－6个月达到最大效果，但停止用药后体将恢复。建议这种药物的使用持续时间不超过2年。
对遗传性瘦素缺乏儿童给以瘦素治疗导致体重显著下降。但值得怀疑的是，非瘦素缺乏的肥胖形式是否能够通过类似的治疗取得效果。
已有两项关于甲福明应用于胰岛素抵抗、正常葡萄糖耐受性和2型糖尿病阳性家庭史肥胖青少年的随机化、双盲、安慰剂对照研究。在第一项实验研究（n=29）中，在无饮食干涉的情况下，甲福明降低了BMI Z分值（3.6%，相对于安慰剂对照组）。在第二项试验（n=24）中，相对于对照组来说，甲福明与低热量饮食一起降低体重2.7%，降低了血浆瘦素、胰岛素、葡萄糖、胆固醇和甘油三酯浓度。
总体上讲，甲福明很好忍受，虽然许多病人有暂时的腹部不适感，但随食物一起服用药物可以避免不适。在儿科病人，乳酸过多症非常少见，但对于心、肝、肾和肠胃道潜在疾病的儿童不能应用甲福明。肝脏酶轻微升高（正常标准3倍以下）的肥胖受试者可接受这种药物。某些研究的确提示，甲福明可能有助于治疗肝脏脂肪变性。甲福明已被食品和药物管理局批准治疗T2DM，但目前尚未批准用于儿童肥胖和胰岛素抵抗的治疗。
奥曲肽（octreotide） 奥曲肽与生长激素抑制素-5受体结合，因此消弱了β细胞钙通道的关闭，减少依赖葡萄糖的胰岛素分泌。在下丘脑性肥胖儿童的双盲、安慰剂对照研究中，奥曲肽减少胰岛素的分泌性反应，降低体重 (＋1.6±0.6对＋9.2±1.5 kg)和BMI（－0.2±0.2对＋2.3±0.5 kg/m2）的增长速度。药物的成本、非肠道处理、以及药物的副作用:包括短暂的胃肠不适、胆结石、GH(生长激素)和TSH分泌的抑制和心脏功能障碍，限制了这种药物在下丘脑损伤引起的难以处理的肥胖病人中的可应用性。